mirror of
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552 lines
13 KiB
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JavaScript
|
import {
|
||
|
|
__commonJS
|
||
|
|
} from "./chunk-2TUXWMP5.js";
|
||
|
|
|
||
|
|
// node_modules/highlight.js/lib/languages/stan.js
|
||
|
|
var require_stan = __commonJS({
|
||
|
|
"node_modules/highlight.js/lib/languages/stan.js"(exports, module) {
|
||
|
|
function stan(hljs) {
|
||
|
|
const BLOCKS = [
|
||
|
|
"functions",
|
||
|
|
"model",
|
||
|
|
"data",
|
||
|
|
"parameters",
|
||
|
|
"quantities",
|
||
|
|
"transformed",
|
||
|
|
"generated"
|
||
|
|
];
|
||
|
|
const STATEMENTS = [
|
||
|
|
"for",
|
||
|
|
"in",
|
||
|
|
"if",
|
||
|
|
"else",
|
||
|
|
"while",
|
||
|
|
"break",
|
||
|
|
"continue",
|
||
|
|
"return"
|
||
|
|
];
|
||
|
|
const SPECIAL_FUNCTIONS = [
|
||
|
|
"print",
|
||
|
|
"reject",
|
||
|
|
"increment_log_prob|10",
|
||
|
|
"integrate_ode|10",
|
||
|
|
"integrate_ode_rk45|10",
|
||
|
|
"integrate_ode_bdf|10",
|
||
|
|
"algebra_solver"
|
||
|
|
];
|
||
|
|
const VAR_TYPES = [
|
||
|
|
"int",
|
||
|
|
"real",
|
||
|
|
"vector",
|
||
|
|
"ordered",
|
||
|
|
"positive_ordered",
|
||
|
|
"simplex",
|
||
|
|
"unit_vector",
|
||
|
|
"row_vector",
|
||
|
|
"matrix",
|
||
|
|
"cholesky_factor_corr|10",
|
||
|
|
"cholesky_factor_cov|10",
|
||
|
|
"corr_matrix|10",
|
||
|
|
"cov_matrix|10",
|
||
|
|
"void"
|
||
|
|
];
|
||
|
|
const FUNCTIONS = [
|
||
|
|
"Phi",
|
||
|
|
"Phi_approx",
|
||
|
|
"abs",
|
||
|
|
"acos",
|
||
|
|
"acosh",
|
||
|
|
"algebra_solver",
|
||
|
|
"append_array",
|
||
|
|
"append_col",
|
||
|
|
"append_row",
|
||
|
|
"asin",
|
||
|
|
"asinh",
|
||
|
|
"atan",
|
||
|
|
"atan2",
|
||
|
|
"atanh",
|
||
|
|
"bernoulli_cdf",
|
||
|
|
"bernoulli_lccdf",
|
||
|
|
"bernoulli_lcdf",
|
||
|
|
"bernoulli_logit_lpmf",
|
||
|
|
"bernoulli_logit_rng",
|
||
|
|
"bernoulli_lpmf",
|
||
|
|
"bernoulli_rng",
|
||
|
|
"bessel_first_kind",
|
||
|
|
"bessel_second_kind",
|
||
|
|
"beta_binomial_cdf",
|
||
|
|
"beta_binomial_lccdf",
|
||
|
|
"beta_binomial_lcdf",
|
||
|
|
"beta_binomial_lpmf",
|
||
|
|
"beta_binomial_rng",
|
||
|
|
"beta_cdf",
|
||
|
|
"beta_lccdf",
|
||
|
|
"beta_lcdf",
|
||
|
|
"beta_lpdf",
|
||
|
|
"beta_rng",
|
||
|
|
"binary_log_loss",
|
||
|
|
"binomial_cdf",
|
||
|
|
"binomial_coefficient_log",
|
||
|
|
"binomial_lccdf",
|
||
|
|
"binomial_lcdf",
|
||
|
|
"binomial_logit_lpmf",
|
||
|
|
"binomial_lpmf",
|
||
|
|
"binomial_rng",
|
||
|
|
"block",
|
||
|
|
"categorical_logit_lpmf",
|
||
|
|
"categorical_logit_rng",
|
||
|
|
"categorical_lpmf",
|
||
|
|
"categorical_rng",
|
||
|
|
"cauchy_cdf",
|
||
|
|
"cauchy_lccdf",
|
||
|
|
"cauchy_lcdf",
|
||
|
|
"cauchy_lpdf",
|
||
|
|
"cauchy_rng",
|
||
|
|
"cbrt",
|
||
|
|
"ceil",
|
||
|
|
"chi_square_cdf",
|
||
|
|
"chi_square_lccdf",
|
||
|
|
"chi_square_lcdf",
|
||
|
|
"chi_square_lpdf",
|
||
|
|
"chi_square_rng",
|
||
|
|
"cholesky_decompose",
|
||
|
|
"choose",
|
||
|
|
"col",
|
||
|
|
"cols",
|
||
|
|
"columns_dot_product",
|
||
|
|
"columns_dot_self",
|
||
|
|
"cos",
|
||
|
|
"cosh",
|
||
|
|
"cov_exp_quad",
|
||
|
|
"crossprod",
|
||
|
|
"csr_extract_u",
|
||
|
|
"csr_extract_v",
|
||
|
|
"csr_extract_w",
|
||
|
|
"csr_matrix_times_vector",
|
||
|
|
"csr_to_dense_matrix",
|
||
|
|
"cumulative_sum",
|
||
|
|
"determinant",
|
||
|
|
"diag_matrix",
|
||
|
|
"diag_post_multiply",
|
||
|
|
"diag_pre_multiply",
|
||
|
|
"diagonal",
|
||
|
|
"digamma",
|
||
|
|
"dims",
|
||
|
|
"dirichlet_lpdf",
|
||
|
|
"dirichlet_rng",
|
||
|
|
"distance",
|
||
|
|
"dot_product",
|
||
|
|
"dot_self",
|
||
|
|
"double_exponential_cdf",
|
||
|
|
"double_exponential_lccdf",
|
||
|
|
"double_exponential_lcdf",
|
||
|
|
"double_exponential_lpdf",
|
||
|
|
"double_exponential_rng",
|
||
|
|
"e",
|
||
|
|
"eigenvalues_sym",
|
||
|
|
"eigenvectors_sym",
|
||
|
|
"erf",
|
||
|
|
"erfc",
|
||
|
|
"exp",
|
||
|
|
"exp2",
|
||
|
|
"exp_mod_normal_cdf",
|
||
|
|
"exp_mod_normal_lccdf",
|
||
|
|
"exp_mod_normal_lcdf",
|
||
|
|
"exp_mod_normal_lpdf",
|
||
|
|
"exp_mod_normal_rng",
|
||
|
|
"expm1",
|
||
|
|
"exponential_cdf",
|
||
|
|
"exponential_lccdf",
|
||
|
|
"exponential_lcdf",
|
||
|
|
"exponential_lpdf",
|
||
|
|
"exponential_rng",
|
||
|
|
"fabs",
|
||
|
|
"falling_factorial",
|
||
|
|
"fdim",
|
||
|
|
"floor",
|
||
|
|
"fma",
|
||
|
|
"fmax",
|
||
|
|
"fmin",
|
||
|
|
"fmod",
|
||
|
|
"frechet_cdf",
|
||
|
|
"frechet_lccdf",
|
||
|
|
"frechet_lcdf",
|
||
|
|
"frechet_lpdf",
|
||
|
|
"frechet_rng",
|
||
|
|
"gamma_cdf",
|
||
|
|
"gamma_lccdf",
|
||
|
|
"gamma_lcdf",
|
||
|
|
"gamma_lpdf",
|
||
|
|
"gamma_p",
|
||
|
|
"gamma_q",
|
||
|
|
"gamma_rng",
|
||
|
|
"gaussian_dlm_obs_lpdf",
|
||
|
|
"get_lp",
|
||
|
|
"gumbel_cdf",
|
||
|
|
"gumbel_lccdf",
|
||
|
|
"gumbel_lcdf",
|
||
|
|
"gumbel_lpdf",
|
||
|
|
"gumbel_rng",
|
||
|
|
"head",
|
||
|
|
"hypergeometric_lpmf",
|
||
|
|
"hypergeometric_rng",
|
||
|
|
"hypot",
|
||
|
|
"inc_beta",
|
||
|
|
"int_step",
|
||
|
|
"integrate_ode",
|
||
|
|
"integrate_ode_bdf",
|
||
|
|
"integrate_ode_rk45",
|
||
|
|
"inv",
|
||
|
|
"inv_Phi",
|
||
|
|
"inv_chi_square_cdf",
|
||
|
|
"inv_chi_square_lccdf",
|
||
|
|
"inv_chi_square_lcdf",
|
||
|
|
"inv_chi_square_lpdf",
|
||
|
|
"inv_chi_square_rng",
|
||
|
|
"inv_cloglog",
|
||
|
|
"inv_gamma_cdf",
|
||
|
|
"inv_gamma_lccdf",
|
||
|
|
"inv_gamma_lcdf",
|
||
|
|
"inv_gamma_lpdf",
|
||
|
|
"inv_gamma_rng",
|
||
|
|
"inv_logit",
|
||
|
|
"inv_sqrt",
|
||
|
|
"inv_square",
|
||
|
|
"inv_wishart_lpdf",
|
||
|
|
"inv_wishart_rng",
|
||
|
|
"inverse",
|
||
|
|
"inverse_spd",
|
||
|
|
"is_inf",
|
||
|
|
"is_nan",
|
||
|
|
"lbeta",
|
||
|
|
"lchoose",
|
||
|
|
"lgamma",
|
||
|
|
"lkj_corr_cholesky_lpdf",
|
||
|
|
"lkj_corr_cholesky_rng",
|
||
|
|
"lkj_corr_lpdf",
|
||
|
|
"lkj_corr_rng",
|
||
|
|
"lmgamma",
|
||
|
|
"lmultiply",
|
||
|
|
"log",
|
||
|
|
"log10",
|
||
|
|
"log1m",
|
||
|
|
"log1m_exp",
|
||
|
|
"log1m_inv_logit",
|
||
|
|
"log1p",
|
||
|
|
"log1p_exp",
|
||
|
|
"log2",
|
||
|
|
"log_determinant",
|
||
|
|
"log_diff_exp",
|
||
|
|
"log_falling_factorial",
|
||
|
|
"log_inv_logit",
|
||
|
|
"log_mix",
|
||
|
|
"log_rising_factorial",
|
||
|
|
"log_softmax",
|
||
|
|
"log_sum_exp",
|
||
|
|
"logistic_cdf",
|
||
|
|
"logistic_lccdf",
|
||
|
|
"logistic_lcdf",
|
||
|
|
"logistic_lpdf",
|
||
|
|
"logistic_rng",
|
||
|
|
"logit",
|
||
|
|
"lognormal_cdf",
|
||
|
|
"lognormal_lccdf",
|
||
|
|
"lognormal_lcdf",
|
||
|
|
"lognormal_lpdf",
|
||
|
|
"lognormal_rng",
|
||
|
|
"machine_precision",
|
||
|
|
"matrix_exp",
|
||
|
|
"max",
|
||
|
|
"mdivide_left_spd",
|
||
|
|
"mdivide_left_tri_low",
|
||
|
|
"mdivide_right_spd",
|
||
|
|
"mdivide_right_tri_low",
|
||
|
|
"mean",
|
||
|
|
"min",
|
||
|
|
"modified_bessel_first_kind",
|
||
|
|
"modified_bessel_second_kind",
|
||
|
|
"multi_gp_cholesky_lpdf",
|
||
|
|
"multi_gp_lpdf",
|
||
|
|
"multi_normal_cholesky_lpdf",
|
||
|
|
"multi_normal_cholesky_rng",
|
||
|
|
"multi_normal_lpdf",
|
||
|
|
"multi_normal_prec_lpdf",
|
||
|
|
"multi_normal_rng",
|
||
|
|
"multi_student_t_lpdf",
|
||
|
|
"multi_student_t_rng",
|
||
|
|
"multinomial_lpmf",
|
||
|
|
"multinomial_rng",
|
||
|
|
"multiply_log",
|
||
|
|
"multiply_lower_tri_self_transpose",
|
||
|
|
"neg_binomial_2_cdf",
|
||
|
|
"neg_binomial_2_lccdf",
|
||
|
|
"neg_binomial_2_lcdf",
|
||
|
|
"neg_binomial_2_log_lpmf",
|
||
|
|
"neg_binomial_2_log_rng",
|
||
|
|
"neg_binomial_2_lpmf",
|
||
|
|
"neg_binomial_2_rng",
|
||
|
|
"neg_binomial_cdf",
|
||
|
|
"neg_binomial_lccdf",
|
||
|
|
"neg_binomial_lcdf",
|
||
|
|
"neg_binomial_lpmf",
|
||
|
|
"neg_binomial_rng",
|
||
|
|
"negative_infinity",
|
||
|
|
"normal_cdf",
|
||
|
|
"normal_lccdf",
|
||
|
|
"normal_lcdf",
|
||
|
|
"normal_lpdf",
|
||
|
|
"normal_rng",
|
||
|
|
"not_a_number",
|
||
|
|
"num_elements",
|
||
|
|
"ordered_logistic_lpmf",
|
||
|
|
"ordered_logistic_rng",
|
||
|
|
"owens_t",
|
||
|
|
"pareto_cdf",
|
||
|
|
"pareto_lccdf",
|
||
|
|
"pareto_lcdf",
|
||
|
|
"pareto_lpdf",
|
||
|
|
"pareto_rng",
|
||
|
|
"pareto_type_2_cdf",
|
||
|
|
"pareto_type_2_lccdf",
|
||
|
|
"pareto_type_2_lcdf",
|
||
|
|
"pareto_type_2_lpdf",
|
||
|
|
"pareto_type_2_rng",
|
||
|
|
"pi",
|
||
|
|
"poisson_cdf",
|
||
|
|
"poisson_lccdf",
|
||
|
|
"poisson_lcdf",
|
||
|
|
"poisson_log_lpmf",
|
||
|
|
"poisson_log_rng",
|
||
|
|
"poisson_lpmf",
|
||
|
|
"poisson_rng",
|
||
|
|
"positive_infinity",
|
||
|
|
"pow",
|
||
|
|
"print",
|
||
|
|
"prod",
|
||
|
|
"qr_Q",
|
||
|
|
"qr_R",
|
||
|
|
"quad_form",
|
||
|
|
"quad_form_diag",
|
||
|
|
"quad_form_sym",
|
||
|
|
"rank",
|
||
|
|
"rayleigh_cdf",
|
||
|
|
"rayleigh_lccdf",
|
||
|
|
"rayleigh_lcdf",
|
||
|
|
"rayleigh_lpdf",
|
||
|
|
"rayleigh_rng",
|
||
|
|
"reject",
|
||
|
|
"rep_array",
|
||
|
|
"rep_matrix",
|
||
|
|
"rep_row_vector",
|
||
|
|
"rep_vector",
|
||
|
|
"rising_factorial",
|
||
|
|
"round",
|
||
|
|
"row",
|
||
|
|
"rows",
|
||
|
|
"rows_dot_product",
|
||
|
|
"rows_dot_self",
|
||
|
|
"scaled_inv_chi_square_cdf",
|
||
|
|
"scaled_inv_chi_square_lccdf",
|
||
|
|
"scaled_inv_chi_square_lcdf",
|
||
|
|
"scaled_inv_chi_square_lpdf",
|
||
|
|
"scaled_inv_chi_square_rng",
|
||
|
|
"sd",
|
||
|
|
"segment",
|
||
|
|
"sin",
|
||
|
|
"singular_values",
|
||
|
|
"sinh",
|
||
|
|
"size",
|
||
|
|
"skew_normal_cdf",
|
||
|
|
"skew_normal_lccdf",
|
||
|
|
"skew_normal_lcdf",
|
||
|
|
"skew_normal_lpdf",
|
||
|
|
"skew_normal_rng",
|
||
|
|
"softmax",
|
||
|
|
"sort_asc",
|
||
|
|
"sort_desc",
|
||
|
|
"sort_indices_asc",
|
||
|
|
"sort_indices_desc",
|
||
|
|
"sqrt",
|
||
|
|
"sqrt2",
|
||
|
|
"square",
|
||
|
|
"squared_distance",
|
||
|
|
"step",
|
||
|
|
"student_t_cdf",
|
||
|
|
"student_t_lccdf",
|
||
|
|
"student_t_lcdf",
|
||
|
|
"student_t_lpdf",
|
||
|
|
"student_t_rng",
|
||
|
|
"sub_col",
|
||
|
|
"sub_row",
|
||
|
|
"sum",
|
||
|
|
"tail",
|
||
|
|
"tan",
|
||
|
|
"tanh",
|
||
|
|
"target",
|
||
|
|
"tcrossprod",
|
||
|
|
"tgamma",
|
||
|
|
"to_array_1d",
|
||
|
|
"to_array_2d",
|
||
|
|
"to_matrix",
|
||
|
|
"to_row_vector",
|
||
|
|
"to_vector",
|
||
|
|
"trace",
|
||
|
|
"trace_gen_quad_form",
|
||
|
|
"trace_quad_form",
|
||
|
|
"trigamma",
|
||
|
|
"trunc",
|
||
|
|
"uniform_cdf",
|
||
|
|
"uniform_lccdf",
|
||
|
|
"uniform_lcdf",
|
||
|
|
"uniform_lpdf",
|
||
|
|
"uniform_rng",
|
||
|
|
"variance",
|
||
|
|
"von_mises_lpdf",
|
||
|
|
"von_mises_rng",
|
||
|
|
"weibull_cdf",
|
||
|
|
"weibull_lccdf",
|
||
|
|
"weibull_lcdf",
|
||
|
|
"weibull_lpdf",
|
||
|
|
"weibull_rng",
|
||
|
|
"wiener_lpdf",
|
||
|
|
"wishart_lpdf",
|
||
|
|
"wishart_rng"
|
||
|
|
];
|
||
|
|
const DISTRIBUTIONS = [
|
||
|
|
"bernoulli",
|
||
|
|
"bernoulli_logit",
|
||
|
|
"beta",
|
||
|
|
"beta_binomial",
|
||
|
|
"binomial",
|
||
|
|
"binomial_logit",
|
||
|
|
"categorical",
|
||
|
|
"categorical_logit",
|
||
|
|
"cauchy",
|
||
|
|
"chi_square",
|
||
|
|
"dirichlet",
|
||
|
|
"double_exponential",
|
||
|
|
"exp_mod_normal",
|
||
|
|
"exponential",
|
||
|
|
"frechet",
|
||
|
|
"gamma",
|
||
|
|
"gaussian_dlm_obs",
|
||
|
|
"gumbel",
|
||
|
|
"hypergeometric",
|
||
|
|
"inv_chi_square",
|
||
|
|
"inv_gamma",
|
||
|
|
"inv_wishart",
|
||
|
|
"lkj_corr",
|
||
|
|
"lkj_corr_cholesky",
|
||
|
|
"logistic",
|
||
|
|
"lognormal",
|
||
|
|
"multi_gp",
|
||
|
|
"multi_gp_cholesky",
|
||
|
|
"multi_normal",
|
||
|
|
"multi_normal_cholesky",
|
||
|
|
"multi_normal_prec",
|
||
|
|
"multi_student_t",
|
||
|
|
"multinomial",
|
||
|
|
"neg_binomial",
|
||
|
|
"neg_binomial_2",
|
||
|
|
"neg_binomial_2_log",
|
||
|
|
"normal",
|
||
|
|
"ordered_logistic",
|
||
|
|
"pareto",
|
||
|
|
"pareto_type_2",
|
||
|
|
"poisson",
|
||
|
|
"poisson_log",
|
||
|
|
"rayleigh",
|
||
|
|
"scaled_inv_chi_square",
|
||
|
|
"skew_normal",
|
||
|
|
"student_t",
|
||
|
|
"uniform",
|
||
|
|
"von_mises",
|
||
|
|
"weibull",
|
||
|
|
"wiener",
|
||
|
|
"wishart"
|
||
|
|
];
|
||
|
|
return {
|
||
|
|
name: "Stan",
|
||
|
|
aliases: ["stanfuncs"],
|
||
|
|
keywords: {
|
||
|
|
$pattern: hljs.IDENT_RE,
|
||
|
|
title: BLOCKS,
|
||
|
|
keyword: STATEMENTS.concat(VAR_TYPES).concat(SPECIAL_FUNCTIONS),
|
||
|
|
built_in: FUNCTIONS
|
||
|
|
},
|
||
|
|
contains: [
|
||
|
|
hljs.C_LINE_COMMENT_MODE,
|
||
|
|
hljs.COMMENT(
|
||
|
|
/#/,
|
||
|
|
/$/,
|
||
|
|
{
|
||
|
|
relevance: 0,
|
||
|
|
keywords: {
|
||
|
|
"meta-keyword": "include"
|
||
|
|
}
|
||
|
|
}
|
||
|
|
),
|
||
|
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hljs.COMMENT(
|
||
|
|
/\/\*/,
|
||
|
|
/\*\//,
|
||
|
|
{
|
||
|
|
relevance: 0,
|
||
|
|
// highlight doc strings mentioned in Stan reference
|
||
|
|
contains: [
|
||
|
|
{
|
||
|
|
className: "doctag",
|
||
|
|
begin: /@(return|param)/
|
||
|
|
}
|
||
|
|
]
|
||
|
|
}
|
||
|
|
),
|
||
|
|
{
|
||
|
|
// hack: in range constraints, lower must follow "<"
|
||
|
|
begin: /<\s*lower\s*=/,
|
||
|
|
keywords: "lower"
|
||
|
|
},
|
||
|
|
{
|
||
|
|
// hack: in range constraints, upper must follow either , or <
|
||
|
|
// <lower = ..., upper = ...> or <upper = ...>
|
||
|
|
begin: /[<,]\s*upper\s*=/,
|
||
|
|
keywords: "upper"
|
||
|
|
},
|
||
|
|
{
|
||
|
|
className: "keyword",
|
||
|
|
begin: /\btarget\s*\+=/,
|
||
|
|
relevance: 10
|
||
|
|
},
|
||
|
|
{
|
||
|
|
begin: "~\\s*(" + hljs.IDENT_RE + ")\\s*\\(",
|
||
|
|
keywords: DISTRIBUTIONS
|
||
|
|
},
|
||
|
|
{
|
||
|
|
className: "number",
|
||
|
|
variants: [
|
||
|
|
{
|
||
|
|
begin: /\b\d+(?:\.\d*)?(?:[eE][+-]?\d+)?/
|
||
|
|
},
|
||
|
|
{
|
||
|
|
begin: /\.\d+(?:[eE][+-]?\d+)?\b/
|
||
|
|
}
|
||
|
|
],
|
||
|
|
relevance: 0
|
||
|
|
},
|
||
|
|
{
|
||
|
|
className: "string",
|
||
|
|
begin: '"',
|
||
|
|
end: '"',
|
||
|
|
relevance: 0
|
||
|
|
}
|
||
|
|
]
|
||
|
|
};
|
||
|
|
}
|
||
|
|
module.exports = stan;
|
||
|
|
}
|
||
|
|
});
|
||
|
|
|
||
|
|
export {
|
||
|
|
require_stan
|
||
|
|
};
|
||
|
|
//# sourceMappingURL=chunk-SLBUMATW.js.map
|